Gephi是一款开源免费跨平台基于JVM的复杂网络分析软件, 其主要用于各种网络和复杂系统, 特别是在处理网络关系数据这方面很有优势,下面是两个不错的例子 编程语言关系图 
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那么,我们拿到图数据后, 应该如何画出这个图表呢？ 图表绘制 通过分析上面两个例子的代码可知,前端插件用的都是 sigma.js ,但是在展示网络数据的时候插件并不会自动的对节点和边进行布局,需要通过后台传给前台数据文件,常用的有两种格式 json 和 gexf 虽然gephi是一个gui程序,但是它提供了一套叫 gephi-toolkit 的东西,可以方便的编程化方式处理数据, 首先加入gephi仓库并引入依赖 - <repositories>
- <repository>
- <id>gephi-snapshots</id>
- <name>Gephi Snapshots</name>
- <url>http://nexus.gephi.org/nexus/content/repositories/snapshots/</url>
- </repository>
- <repository>
- <id>gephi-releases</id>
- <name>Gephi Releases</name>
- <url>http://nexus.gephi.org/nexus/content/repositories/releases/</url>
- </repository>
- </repositories>
- <dependencies>
- <dependency>
- <groupId>org.gephi</groupId>
- <artifactId>gephi-toolkit</artifactId>
- <version>0.8.2</version>
- </dependency>
- </dependencies>
添加依赖完成之后,可以参考这个 slide 熟悉一下API 布局算法 布局算法是图算法的一大部分, 常用的有 Force-directed_graph_drawing 力导向算法, 其基本思想是: 对网络状态进行初始化 计算每次迭代局部区域内，两两节点间的斥力所产生的单位位移（一般为正值） 计算每次迭代每条边的引力对两端节点所产生的单位位移（一般为负值） 上面两步中的斥力和引力系数直接影响到最终态的理想效果，它与节点间的距离、节点在系统所在区域的平均单位区域均有关，需要开发人员在实践中不断调整 累加所有节点的单位位移，结合单次最大移动距离确定每个节点新的位置 迭代n次,达到最优效果 gephi-tookit中也自带了几种布局算法, 而且易于使用, 如果你的数据源是数据库, 可以参考 这个例子 ,当然也可以纯手工构建一个图, 示例代码如下所示: - ProjectController pc = Lookup.getDefault().lookup(ProjectController.class);
- pc.newProject();
- Workspace workspace = pc.getCurrentWorkspace();
- //Generate a new random graph into a container
- Container container = Lookup.getDefault().lookup(ContainerFactory.class).newContainer();
- GraphModel graphModel = Lookup.getDefault().lookup(GraphController.class).getModel();
- DirectedGraph graph = graphModel.getDirectedGraph();
- Node n0 = graphModel.factory().newNode("n0");
- n0.getNodeData().setLabel("n0");
- Node n1 = graphModel.factory().newNode("n1");
- n1.getNodeData().setLabel("n1");
- Edge edge = graphModel.factory().newEdge(n0, n1, 1f, true);
- graph.addNode(n0);
- graph.addNode(n1);
- graph.addEdge(edge);
- for(int i = 0 ; i < 100; i++) {
- Node ntmp = graphModel.factory().newNode("tmp" + i);
- Edge edgetmp = graphModel.factory().newEdge(n0, ntmp, 1f, true);
- graph.addNode(ntmp);
- graph.addEdge(edgetmp);
- }
- System.out.println("Nodes: " + graph.getNodeCount());
- System.out.println("Edges: " + graph.getEdgeCount());
- //Layout for 15 seconds
- AutoLayout autoLayout = new AutoLayout(20, TimeUnit.SECONDS);
- autoLayout.setGraphModel(graphModel);
- YifanHuLayout firstLayout = new YifanHuLayout(null, new StepDisplacement(1f));
- ForceAtlasLayout secondLayout = new ForceAtlasLayout(null);
- AutoLayout.DynamicProperty adjustBySizeProperty = AutoLayout.createDynamicProperty("forceAtlas.adjustSizes.name", Boolean.TRUE, 0.1f);//True after 10% of layout time
- AutoLayout.DynamicProperty repulsionProperty = AutoLayout.createDynamicProperty("forceAtlas.repulsionStrength.name", new Double(500.), 0f);//500 for the complete period
- autoLayout.addLayout(firstLayout, 0.9f);
- autoLayout.addLayout(secondLayout, 0.1f, new AutoLayout.DynamicProperty[]{adjustBySizeProperty, repulsionProperty});
- autoLayout.execute();
- //Export pdf & gexf
- ExportController ec = Lookup.getDefault().lookup(ExportController.class);
- try {
- File pdfFile = new File("/tmp/data.pdf");
- File gexfFile = new File("/tmp/data.gexf");
- pdfFile.getParentFile().mkdirs();
- gexfFile.getParentFile().mkdirs();
- ec.exportFile(pdfFile);
- ec.exportFile(gexfFile);
- } catch (IOException ex) {
- ex.printStackTrace();
- }
其中导出的 gexf 数据文件可以用于 sigmajs的展示 参考资料 http://gephi.github.io/ http://www.slideshare.net/gephi/gephi-toolkit-tutorialtoolkit https://github.com/gephi/gephi/wiki/How-to-code-with-the-Toolkit THE END 声明: 本文 “Gephi简介” 采用 CC BY-NC-SA 4.0 协议进行授权. 转载请注明原文地址: http://stackbox.org/2015-08-about-gephi/index.html | 
